Il gameplay è sostanzialmente lo stesso del primo capitolo, una miscela tra picchiaduro e azione. Devi allestire una squadra di quattro supereroi a scelta fra un carnet piuttosto vasto e affrontare i nemici.
La “grande” novità di questo nuovo capitolo è la possibilità di combinare gli attacchi di due personaggi del team per ottenere spettacolari mosse speciali. Personaggi sbloccabili con punti esperienza e abilità. La squadra può essere cambiata anche durante il gioco. Qualsiasi elemento dell’ambiente può essere sollevato e lanciato.
Ecco la lista dei personaggi giocabili (accanto i loro costumi alternativi):
Capitan America | Seconda Guerra Mondiale
Iron Man | Classico
Thor
Hulk | Hulk Rosso
Mister Fantastic | Ultimate
Donna invisibile | Ultimate
Torcia Umana | Ultimate
La Cosa | Ultimate
Spider-Man | Iron Spider-Man
Tempesta | Classico
Wolverine | Secret Wars
Daredevil | Secret Wars
Songbird
Luke Cage | Secret Wars
Ms. Marvel
Deadpool | Senza maschera (Ultimate Spider-man n°93)
Venom | Eddie Brock
Green Goblin | Hobgoblin
Gambit | Cavaliere dell’Apocallisse
Jean Grey
Penance | Senza armatura
Uomo Ghiaccio | Con giacca
Cyborg Nick Fury
Marvel: La Grande Alleanza 2 avrà dei personaggi esclusivi per ogni console:
Pugno d’acciaio (disponibile solo per Xbox 360 e Playstation 3)
Il Fenomeno (disponibile solo per Xbox 360 e Playstation 3)
Blade (disponibile solo per Nintendo Wii, Playstation 2 e PSP)
Ciclope (disponibile solo per Nintendo Wii, Playstation 2 e PSP)
Psylocke (disponibile solo per Nintendo Wii, Playstation 2 e PSP)
Sentry (disponibile solo per Nintendo DS)
She-Hulk (disponibile solo per Nintendo DS)
È stato inoltre annunciato che molto presto verrà lanciata sul mercato un download pack con personaggi nuovi. Tra questi sono stati confermati Carnage, Psylocke e Cable.
Invece questi sono i personaggi non giocabili che appariranno durante il gioco:
Alfiere
Cable
Henry Pym
Namorita
Wonder Man
Pantera Nera
Ercole
Cloak e Dagger
Vedova Nera
Firestar
Prodigy
Valentina De La Fontaine
Havok
Spider-Woman
Uomo Multiplo
Maria Hill
Patriot
Golia Nero
War Machine
Justice
Colosso
Inoltre sembra confermato che, nonostante appaia come personaggio giocabile per la versione Nintendo DS, il personaggio di She-Hulk apparirà comunque nel videogioco.
È confermato, invece, che la versione del videogioco per Nintendo Wii, Playstation 2 e PSP conterrà dei personaggi non giocabili esclusivi: Soldato d’Inverno, l’Uomo Assorbente, Scorpione, Magneto, Lizard, Grey Gargoyle e Quicksilver.
Lo sceneggiatore di fumetti Marvel Comics Stan Lee appare nel ruolo di un senatore da salvare durante il primo atto.
Questi sono alcuni dei nemici annunciati che vedremo nel videogame:
Dottor Destino
Molten
Titanium Man
Electro
Lucia von Bardas
Jack Lanterna
Wizard
Whiplash
Nitro
Bullseye
Shocker
Diamante
Equinox
Trottola Umana
A-Bomb
Riparatore
Mietitore Sinistro
Moonstone
Lady Deathstrike
Ustionatore